Norbert Antoine de Patek, một thợ đồng hồ người Ba Lan, đã bắt đầu chế tạo những chiếc đồ hồ bỏ túi năm 1839 tại Geneva cùng với người đồng hương Franciszek Czapek. Họ dừng hợp tác với nhau năm 1844. Năm 1845 Patek hợp tác với Adrien Philippe, thợ đồng hồ người Pháp, người phát minh ra cơ chế lên dây không cần chìa. Patek Philippe & Co ra đời năm 1851.

Năm 1868, Patek Philippe đã chế tác đồng hồ đeo tay Thụy Sĩ đầu tiên cho nữ bá tước Koscowicz của Hungary.[19]

Vào tháng 3 năm 1877, Antoni Patek đã qua đời ở tuổi 65, nhưng con trai duy nhất của ông, Léon Mecyslas Vincent, đã không nối nghiệp cha ông. Kết quả là Joseph Antoine Bénassy-Philippe, một trong những người con rể của Adrien Philippe, đã kế vị vị trí của Antoni Patek.[19]

Năm 2010, công ty đã sản xuất 40.000 chiếc đồng hồ[20] Theo Thierry Stern, năm 2012, công ty đã sản xuất 50.000 chiếc.[21].

Từ năm 1932, công ty thuộc sở hữu của gia đình Stern, được lãnh đạo bởi Philippe Stern và con trai Thierry Stern được chuyển giao quyền lãnh đạo từ cha năm 2010.[20]

Cho đến tận thời điểm này, Thierry Stern vẫn giữ nguyên tắc: Muốn mua đồng hồ, khách hàng phải gửi hồ sơ đăng ký trực tiếp với hãng. Hãng sẽ xét bán theo thứ tự ưu tiên: Danh nhân thế giới; Chính khách quyền lực; Nghệ sĩ nổi tiếng và cuối cùng là giàu có. Mỗi chiếc đồng hồ được xuất xưởng, chắc chắn sẽ mang sứ mệnh phục vụ cho một bậc danh tài của thế giới. Vì thế, Patek Philippe không xây dựng bất cứ một đại lý nào trên toàn thế giới mà chỉ bán trực tiếp cho khách hàng. Mỗi khi hoàn tất một chiếc đồng hồ, hãng thực hiện một buổi lễ khai sinh và đặt tên. Vì vậy, mỗi chiếc đồng hồ đều có nhân thân riêng biệt. Bộ giấy khai sinh của mỗi chiếc được lưu trữ trong tàng thư của hãng.[14]